出料的后处理为大型沼气工程所不可缺少的构成部分｡过去有些工程未考虑出料的后处理问题,造成出料的二次污染,使沼气工程周围环境不堪入目,白白浪费了可作为绿色安全食品生产用肥料的物质资源｡

出料后处理的方式多种多样,最简便的是直接用作肥料施入土壤或鱼塘｡但施用有季节性,不能保证连续的后处理｡可靠的方法是将出料进行沉淀后再将沉渣进行固液分离,固体残渣用作肥料或配合适量化肥做成适用于各种花果的复合肥料,很受市场欢迎,并有较好经济效益｡清液部分应首先考虑用作液肥,也可经曝气池､氧化塘等好氧处理设备后排放,经好氧处理过的污水可用于灌溉或再回用为生产用水｡目前采用的固液分离方式有沙滤式干化槽､卧螺式离心机､水力筛､带式压滤机和螺旋挤压式固液分离机等｡